PHARMACEUTICAL INFORMATICS

了解平台

平台介绍

  广州市药物信息学公共服务平台是广州地区首次创建的集药物分子设计、云计算和高性能计算(超算)三大技术为一体平台。平台为广州生物工程中心与中山大学药物分子设计研究中心共同研究开发,通过生物应用软件的“芯片化”重组完成新的功能,旨在更加高效地进行药物研发,提升广州地区生物制药企业药物设计与发现水平和创新能力。
    平台包括基于配体-靶标网络的抗2型糖尿病药物设计平台、基于配体的药物筛选平台(LBVS)、靶标依赖的分子相似度算法以及在虚拟筛选中应用、活性标注的化合物骨架数据库(ASDB)等系统工具。
    ※  基于配体-靶标网络的抗2型糖尿病药物设计平台基于配体-靶标网络分析方法对化学基元进行重组,产生有抗糖尿病潜力的虚拟分子,对其中化合物进行抗2型糖尿病的活性、骨架新颖性、合成可行性和成药性评估。
    ※  基于配体的药物筛选平台(LBVS)利用业界知名开源数据库BindingDB和ChEMBL作为数据来源,挖掘靶标和化合物活性数据,利用贝叶斯学习作为机器学习引擎,实现在线提交研究靶标,设置虚拟筛选参数,选择筛选库,进行在线建模,模型验证和虚拟筛选,得到虚拟筛选候选化合物。
    ※  靶标依赖的分子相似度算法利用自主开发的化学信息学平台,对ChEMBL数据库中靶向抑制剂信息进行挖掘,在建立的六个靶标基准测试体系中,发现靶标依赖的相似度算法较传统相似度算法具有优越性,能较好区分活性分子与非活性分子。
    ※  活性标注的化合物骨架数据库(ASDB)提供系列检索工具,包括全结构、子结构检索,相似度检索(2D/3D),以及文本检索。同时ASDB提供在线构建骨架-靶标网络服务,可以基于用户提供的骨架或者靶标,构建骨架与靶标之间的关系。
  欢迎广大科研工作者使用平台,同时期盼您的宝贵意见和建议,希望平台能为您的药物研发工作提供帮助。


CopyRight 2015 广州生物工程中心  中山大学药物分子设计研究中心 All Rights Reserved.

10075578号-1

0.0242s