基于配体-靶标网络的抗2型糖尿病药物设计平台

  2型糖尿病(T2D)是系统性代谢疾病。因发病机制复杂,目前临床使用的抗T2D药物疗效不理想。发现新的抗T2D药物仍然是研究热点。我们新建立了基于配体-靶标网络分析方法。收集抗T2D靶标,按照作用机理分为8组,每个靶标组含有一组靶标分子(分为抑制和激动两种调控方式)。而每个靶分子又对应一组小分子调控剂,建立8 棵"配体-靶标"多叉树。





  从"配体-靶标"多叉树提取组成配体的基本化学结构单元(化学基元)组(组成调控剂的核心结构单元),从这些化学基元组导出对应的生物等排体。





  建立抗2 型糖尿病药物化学基元-靶标关系网络。该网络表达抗2 型糖尿病先导化合物的形成规律,是靶向配体分子的设计规则



  结合"化学基元-靶标"关系网络、化学合成规则,根据化学基元的生物等排体、构造抗2 型糖尿病药物分子。对化学基元进行重组,产生有抗糖尿病潜力的虚拟分子(虚拟库)。对虚拟库中化合物进行抗2型糖尿病的活性、骨架新颖性、合成可行性和成药性评估。
  本平台实现了配体-靶标网络拓扑图的可视化显示系统,药物分子的拆分与组合系统等,平台使用案例如下:



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  建立抗2 型糖尿病药物化学基元-靶标关系网络。该网络表达抗2 型糖尿病先导化合物的形成规律,是靶向配体分子的设计规则











  二型糖尿病配体分子基本片段的产生与组合



组合分子虚拟库的展示



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